本スレPart3より

453 名前：ぼるじょあ ◆yBEncckFOU [age] 投稿日：04/11/05 20:09:09 ID:???
（・３・）　エェー　ニュースです、一応みなさん読んでおいて下さい
　　　　　　　　　　今まで解析対象はLIGANDFIT（ガン等）・Smallpox（天然痘）でした
　　　　　　　　　　UDフォーラムでのアナウンスによると天然痘解析が完了したそうです
　　　　　　　　　　ですので“天然痘のみ”のプロファイルを作って解析していた方も、
　　　　　　　　　　自動的にガン解析へと移行しているはずです
　　　　　　　　　　ガン解析（LIGANDFIT）は硬いので１個の宿題を解析する時間が、
　　　　　　　　　　１日以上になる場合もあります。ﾏﾀｰﾘいきましょう

元々、Smallpox（天然痘解析）がUDに含まれた経緯は時期的にも911テロ関連だったと思われます
（多分）
911当時スレはこちらに残ってたりします
http://perape.hp.infoseek.co.jp/column/800/colm_872.htm

航空板スレ
http://mentai.2ch.net/space/kako/1000/10002/1000213219.html

Smallpox has been completed.
http://forum.grid.org/phpBB/viewtopic.php?t=14872

英語ですので簡易日本語訳を下記に…
↓
天然痘は完了しました。今晩天然痘に関する解析を止めます。
天然痘のみを選択している人は、ターゲットが無いというメッセージが出て罰金になります。
私たちは天然痘のみを選択している人がすべてのターゲットを解析するようにすぐに修正します。
また、自分でデバイスプロファイルでがんを選択してもいいです。
　私たちの方針では実行するように設定されていたプロジェクトが完了した場合はプロファイルから取り除き、
デフォルトのターゲットに設定します。がんを選択していなかったとしてもプロファイルにはがんが設定され、
あなたのPCはがんを解析し始めるでしょう。


「UD Agent」で実施されていた天然痘プロジェクトのデータ解析が完了
1年9カ月間にわたり実施され、日本のグループ“Team 2ch”の貢献も大

http://www.forest.impress.co.jp/article/2004/11/11/udagentsmallpox.html

本スレPart3より

495 名前：続き[sage] 投稿日：04/11/17 05:49:30 ID:???
みんなが現在解析しているのはLIGANDFIT（ガン等）だと思います
Smallpox（天然痘）は11/05で完了しているので。

で、今回ロゼッタ（ROSETTA）が始まるみたいです
Smallpox同様、デバイスプロファイルでチェックを入れる事により解析対象に選択できます
個人的な意見ですが、LIGANTFITが目的のUDスレですので無理にやる事もないです
当面は様子見でいいかと
次々と解析対象が出てますが、分散コンピューティングとして世界中で数百万人の参加者を
募る事に成功したわけで、仮にLIGANTFITが解析完了になっても別の解析対象が表れて
プロジェクト自体は永続でしょう。

ではヤメ時は・・って事ですが、Team2chとしてはLIGANTFITの解析が最たる狙いです
その後は個人の判断でエイズやアルツハイマー、宇宙人探索等、
様々なプロジェクトをやるもよし、やめるもよしですね

ロゼッタって何？（他板からの実際導入した方々の情報等）　>>496

496 名前：続き[sage] 投稿日：04/11/17 06:00:09 ID:???
Human Proteome Folding Project

The Human Proteome Folding Project analyzes sequence data
from the Human Genome to predict how the proteins coded there
are likely to function. Since proteins directly affect human health
and are key targets in developing disease treatments, understanding
their structure and function is critical. At present only a fraction
of human protein structures are known -- this project seeks to
dramatically increase that number and make the data available
to scientists for further study by the end of 2005.

_/_/_/_/_/_/_/_/_/_/_/_/_/_/_/_/_/_/_/_日本語訳_/_/_/_/_/_/_/_/_/_/_/_/_/_/_/_/_/_/_/_
ヒトプロテオームのFoldingプロジェクト
ヒトプロテオームのFoldingプロジェクトは、そこにコード化された蛋白質がどのように機能するか
予言するためにヒトゲノムからのシーケンス・データを分析します。
蛋白質は直接人間の健康に影響し、疾病治療を開発する際に重要な対象であるので、
それらの構造および機能の理解は重大です。
現在、人間の蛋白質構造はほんの少しだけ知られています。
―このプロジェクトは、劇的にその数（既知の蛋白質構造の数）を増加させて、
2005年末までに一層の研究用にデータを科学者に利用可能にするように努力します。
_/_/_/_/_/_/_/_/_/_/_/_/_/_/_/_/_/_/_/_/_/_/_/_/_/_/_/_/_/_/_/_/_/_/_/_/_/_/_/_/_/_/_/_

Human Genome Project
http://www.grid.org/projects/hpf/

プロテオームって何？
http://www.tmig.or.jp/J_TMIG/j_topics/topics_186_1.html

497 名前：続き[sage] 投稿日：04/11/17 06:15:46 ID:???
New project
http://forum.grid.org/phpBB/viewtopic.php?t=15024

_/_/_/_/_/_/_/_/_/_/_/_/_/_/_/_/_/_/_/_日本語訳_/_/_/_/_/_/_/_/_/_/_/_/_/_/_/_/_/_/_/_
私たちは、ヒトプロテオームのFoldingプロジェクトという名の新しいプロジェクトを始めました。
完全な情報は　http://www.grid.org/projects/hpf/　にアップしています。
私たちがこのプロジェクトでやりたいことの概要はそこにあります。
DLサイズはかなり大きいのでワークユニットをDLする場合、焦らずまたーり待ってください。
予期されたランタイムは宿題1個当たり20時間くらいかかると思いますしそのように設定してます。
タイムアウトはCPU Timeで２週間、現実世界で3週間です。
そのアプリケーションはロゼッタと呼ばれます。
また、チェックポイントは、構造の端点で定期的にみつかります。
ロゼッタはかなりメモリに集約的で、70MBのRAMおよび300MBの仮想RAMを占めます。
これがあなたのコンピューターには負担が多すぎるとあなたが思うのならば、
私たちは、癌だけを実行するようにプロジェクト選択を変更することを勧めます。
世界コミュニティー・グリッドに切り替えなくてはいけない理由なんてありません。
プロジェクトは同じです。
_/_/_/_/_/_/_/_/_/_/_/_/_/_/_/_/_/_/_/_/_/_/_/_/_/_/_/_/_/_/_/_/_/_/_/_/_/_/_/_/_/_/_/_

以下は導入した方々のスクリーンショット
http://ud.jisaku.aozola.net/img-box/img20041117033521.gif
http://ud.jisaku.aozola.net/img-box/img20041117025422.jpg
http://ud.jisaku.aozola.net/img-box/img20041117020732.jpg

かなりのメモリを食うので、今後出てくる情報等を参考にしながら様子を見たほうがいいかと
又、現在とても混み合っているので、DLに時間が物凄く掛かる
ネットワーク値が２になった、罰金状態が続く等、色々報告が出ています

スペック別解析速度目安（参考までに）
P4 1.6-13分で1.1%　・　P4 2.4-26分で4.2% 　・　PenM 1.4-30分で5%　・　P4 2.4-85分で14%
ｱｽﾛﾝ64 3200+/1024MB-30分で6%　・　Pen4 3.06-15分で5%　・　P4 3.2-25分で10%

498 名前：たま ◆yBEncckFOU [sage] 投稿日：04/11/17 06:33:08 ID:???
(*ﾟ３ﾟ) エェー　長々と書いてみました
　　　　　　　　　情報ソース、日本語訳等はラウンジスレからです
　　　　　　　　　クライアントソフトがここまで大きく変化したのは初かと
　　　　　　　　　これを導入した時に現在のクライアントソフトを削除できないって報告もあり
　　　　　　　　　今後も何か新しい情報が入り次第書いていきます。
　　　　　　　　　質問等も書いておいて頂ければ、時間掛かるかもですが調べてきます

極力余計な事を書かないように気をつけたYO!
ヒトゲノムって聞くとクローン技術問題とか、色々な問題を抱えているけれど、
遅かれ早かれ、そう遠くない未来にはクローンぼるじょあが世界を・・（ﾓｺﾞﾓｺﾞ

あ、>>495の５行目は一応見ておいて下さい
自分は試しに１台の方へ不具合等・レビュー兼ねて導入してみる予定です

-------[参考]-------
Mission UD：白血病等のがん患者を救え！167Ligands
http://ex7.2ch.net/test/read.cgi/entrance/1100521320/351-

501 名前：ぼるじょあ ◆yBEncckFOU [sage] 投稿日：04/11/18 01:01:01 ID:???
>>497
（・３・）　エェー　一部訂正

画像URLの一番上と下２つを見比べて見ると気付くのですが
別のクライアントな予感

Human Proteome Folding Project
参加するにはWorld Community GridからクライアントソフトをDLして解析に参加できる
元々UnitedDevices社のUDagentというソフトがベースなのでほぼそっくりさん
違いは左下のロゴ?部分
“UNITED DEVICES”または“World Community Grid”

UDagentでもデバイスプロファイルにチェックする事で参加可能
TaskInformationで“ROSETTA”と表示されている（ガン等はLIGANTFITになっている）
World Community Gridのクライアントで参加するとこうなっている　“PROTEOME_FOLDING”


一口メモby自作板

【１】ロゼッタ（Rosetta）
問題解決につながる重大な鍵[発見]、
以前解読できなかった謎を理解するのに役立つ鍵[手掛かり]
◆【語源】エジプトで発見されたロゼッタ石（ロゼッタストーン）より

【２】メモリパクパク
899 名前：898[sage] 投稿日：04/11/17 22:12:31 ID:RY+ca4iW
追記、Rosettaは仮想メモリ使用量(約300MB)を含めると370MB程度使いますね・・・。
http://www.imgup.org/file/iup1615.png
Ligandfitの35MB程度に比べるとかなり多いので、
メモリ容量の少ないPCではきついかもしれないです。

WindowsXPでメモリ256は厳しすぎ、メモリ512でもブラが食い込むくらいのピチピチ度

WCGrid_Rosetta.exe
http://www.worldcommunitygrid.org/forums/wcg/viewthread?thread=218

521 名前：ぼるじょあ ◆yBEncckFOU [sage] 投稿日：04/11/23 19:59:47 ID:???
（・３・）　エェー　ロゼッタに関しての注意事項追加ですYO
　　　　　　　　　　デバイスプロファイルにてチェックする項目が２つあります
　　　　　　　　　　LIGANDFIT（ガン等）とROSETTA（ﾋﾄﾌﾟﾛﾃｵｰﾑ）ですNE
　　　　　　　　　　メモリが256以下のPCでROSETTAのみを解析するようにチェックしていると
　　　　　　　　　　一向に解析ができません
　　　　　　　　　　どうやらメモリ256以下のPCではROSETTAの解析が出来ないよう
　　　　　　　　　　制限が設けられているらしいです


ロゼッタに関するまとめ情報・メモリの確認方法・デバイスプロファイルの変更方法等
http://sslu.pupu.jp/ud/rosetta/

523 名前：ぼるじょあ ◆yBEncckFOU [sage] 投稿日：04/11/24 07:26:06 ID:???
！！注意事項！！
UDをインストールしているパソコンのメモリは、256MB以上ですか？

UDをインストールしているパソコンに積んでいるメモリが256MB未満の場合、ロゼッタ用のワークユニット（宿題）をもらう事ができなくなります。
もし、あなたのパソコンのメモリが256MB未満であり、「がん」のチェックを外している場合、宿題は何もやってきませんので注意して下さい。


（；・３・）　エェー　チェックを付ける/外す方法はこちらのページを参考にしてみて下さいＮＥ

http://sslu.pupu.jp/ud/rosetta/chk.html